通过L- 乳酸脱氢酶 1 的上下游 DNA 序列鉴定Lactobacillus sp．DMDL 9010

doi:10.3969/j.issn.1000-565X.2014.03.022

华南理工大学学报（自然科学版） ›› 2014, Vol. 42 ›› Issue (3): 137-144.doi: 10.3969/j.issn.1000-565X.2014.03.022

• 食品科学与技术 • 上一篇

通过L- 乳酸脱氢酶 1 的上下游 DNA 序列鉴定Lactobacillus sp．DMDL 9010

刘冬梅费永涛王盼陈谷肖性龙吴晖唐语谦

华南理工大学轻工与食品学院，广东广州 510640

收稿日期:2013-11-14 出版日期:2014-03-25 发布日期:2014-02-19
通信作者: 刘冬梅(1972-)，女，博士，副教授，主要从事食品微生物的利用与控制研究． E-mail:liudm@scut.edu.cn
作者简介:刘冬梅(1972-)，女，博士，副教授，主要从事食品微生物的利用与控制研究．
基金资助:
国家自然科学基金资助项目(31101254);广东省自然科学基金资助项目(S2011010005679)

Identification of Lactobacillus sp．DMDL 9010 by Upstream and Downstream DNA Sequences of L- Lactate Dehydrogenase 1

Liu Dong- mei Fei Yong- tao Wang Pan Chen Gu Xiao Xing- long Wu Hui Tang Yu- qian

School of Light Industry and Food Sciences,South China University of Technology,Guangzhou 510640,Guangdong,China

Received:2013-11-14 Online:2014-03-25 Published:2014-02-19
Contact: 刘冬梅(1972-)，女，博士，副教授，主要从事食品微生物的利用与控制研究． E-mail:liudm@scut.edu.cn
About author:刘冬梅(1972-)，女，博士，副教授，主要从事食品微生物的利用与控制研究．
Supported by:
国家自然科学基金资助项目(31101254);广东省自然科学基金资助项目(S2011010005679)

摘要/Abstract

摘要： 从发酵蔬菜中分离到乳杆菌 DMDL 9010，将此菌与 LCR 719、 LB 1．83、 ST 1．204和 LP 8140 等4 株乳酸菌用于 MRS 培养基体系中亚硝酸盐的降解，作用24h 后发现，DM-DL 9010 的降解效果最好并具有显著性(P≤0．001)．利用 16SrDNA 将鉴别的范围缩小到植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)或戊糖乳杆菌(Lactobacillus pentosus)，生理生化实验将 DMDL 9010 鉴定为戊糖乳杆菌．但在后续的 PCR 中无法得到戊糖乳杆菌的特异性条带．通过分析两种菌的基因组序列，发现它们都具有编码 L- 乳酸脱氢酶 1 的同源 DNA 序列(ldhL1)，序列相似度达到 90%．同时这段同源序列上下游片段序列相似度较低，其序列的差异可以作为鉴别依据．对 DMDL 9010 的 L- 乳酸脱氢酶 1 基因上下游 900bp 左右的DNA 片段进行 PCR 扩增并测序，利用生物信息学分析方法进行序列比对分析，DMDL9010 被鉴定为植物乳杆菌．

关键词: 细菌, 鉴定, DNA 序列, 发酵

Abstract:

Lactobacillus sp.DMDL 9010 was isolated from fermented vegetables and was used for the degradation ofnitrites in MRS broth,and the results are compared with those of other four lactic acid bacteria including LCR 719,LB 1.83,ST 1.204 and LP 8140,with the best nitrite degradation effect of DMDL 9010 after 24- h fermentation(P≤0.001) being revealed. Then,the identification scope of DMDL 9010 was reduced to Lactobacillus plantarumand Lactobacillus pentosus with the help of 16S rDNA sequence,and the strain was identified as L.pentosus by tes-ting physiological and biochemical characters,although no specific stripe was obtained in the subsequent PCR.More-over,a homologous DNA sequence of L- lactate dehydrogenase 1 (ldhL1) with a similarity of 90% was found in thegenome of L.pentosus and L.plantarum,and the low DNA sequence similarity in the upstream and downstreamfragments of ldhL1 could be regarded as an identification criterion of the two strains.Finally,after the PCR amplifi-cation and sequencing of the upstream and downstream fragments of ldhL1,the above- mentioned sequences werecompared via the bioinformatics analysis,and DMDL 9010 was identified as L.plantarum.

Key words: bacterium, identification, DNA sequence, fermentation

刘冬梅费永涛王盼陈谷肖性龙吴晖唐语谦. 通过L- 乳酸脱氢酶 1 的上下游 DNA 序列鉴定Lactobacillus sp．DMDL 9010[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2014, 42(3): 137-144.

Liu Dong- mei Fei Yong- tao Wang Pan Chen Gu Xiao Xing- long Wu Hui Tang Yu- qian. Identification of Lactobacillus sp．DMDL 9010 by Upstream and Downstream DNA Sequences of L- Lactate Dehydrogenase 1[J]. Journal of South China University of Technology (Natural Science Edition), 2014, 42(3): 137-144.

[1]	李晓玺, 沈少丹, 陆萍, 等. 发酵协同多酚复合对大米淀粉消化性能的影响[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2022, 50(1): 1-8.
[2]	刘冬梅, 余佳佳, 彭鑫, 等. 德氏乳杆菌 DMLD-H1 的生物学特性研究及发酵培养基优化[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2021, 49(3): 71-79.
[3]	刘冬梅, 邝嘉华, 黄燕燕, 等. 复合乳酸菌发酵米发糕风味物质及储存特性[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2021, 49(11): 1-8.
[4]	蒙海林刘复荣何敬愉张文艳张宏刚崔金明. 异养硝化细菌的分离鉴定及组合菌群硝化性能分析[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2019, 47(9): 113-120.
[5]	赵强忠黄丽华陈碧芬蔡勇建邓欣伦赵谋明. 大豆分离蛋白酶解产物对自制酸奶品质的影响[J]. 华南理工大学学报(自然科学版), 2019, 47(3): 85-92.
[6]	李良杨晓宇王雁苏悦江连洲. 植物乳杆菌发酵大豆分离蛋白凝胶的特性分析[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2019, 47(3): 93-100.
[7]	刘冬梅周全兴周劲松. 芽孢杆菌BCS 13002 的鉴定及同步糖化发酵生产高光学纯度L - 乳酸[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2017, 45(9): 81-87.
[8]	赵强忠冯梦莹林恋竹赵谋明. 牛大力糖蛋白的分离、鉴定及抗氧化活性[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2015, 43(11): 8-15.
[9]	孙季丰仝雪珂谭丽. 基于混合统计模型的 DNA 序列压缩算法[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2014, 42(3): 8-14.
[10]	马晓建张霞常春. 丙酮丁醇梭菌发酵玉米秸秆生产丁醇[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2014, 42(2): 27-32.
[11]	徐惠娟梁翠谊许敬亮郭颖张宇庄新姝袁振宏. 合成气发酵梭菌C. autoethanogenum 的生长与CO发酵研究[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2014, 42(11): 136-142.
[12]	刘冬梅陈浩胡小慧吴晖李理. 枯草芽孢杆菌BS H001发酵花生粕的性质表征[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2014, 42(11): 129-135,142.
[13]	李立风任力刘卅王迎军. 医用细菌纤维素的制备及其细胞相容性[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2014, 42(10): 44-49,56.
[14]	江学斌林健聪梁世中. 毕赤酵母产木聚糖酶的动力学及流加策略[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2013, 41(12): 115-119,124.
[15]	宗敏华刘宗俊吴虹娄文勇朱定和. 油脂酵母Trichosporon fermentans HWZ004 的分批补料法高密度培养[J]. 华南理工大学学报（自然科学版）, 2013, 41(10): 47-52,65.

通过L- 乳酸脱氢酶 1 的上下游 DNA 序列鉴定Lactobacillus sp．DMDL 9010

Identification of Lactobacillus sp．DMDL 9010 by Upstream and Downstream DNA Sequences of L- Lactate Dehydrogenase 1

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价